ARBOFRUITS a initialement été créée pour aider les producteurs à la mise en marché des produits de leurs vergers. Elle a longtemps apporté une aide commerciale et logistique au transport des marchandises, œuvrant sur le terrain, entre autre au maintien à la terre des petits producteurs. L'association se concentre aujourd'hui sur le conseil technique, la veille phytosanitaire et le recueil de données statistiques. Bien qu'elle ne commercialise plus les productions de ses adhérents depuis 2004, ARBOFRUITS poursuit aussi sa mission d'appui à la commercialisation. 

L’Association est administrée par un Conseil d'Administration composé de producteurs.

Elle est également reconnue OPA depuis 2009 (agrément renouvelé en 2016).

En 2018 elle compte 16 salariés, dont:

-  11 techniciens (6 dans le Nord et 5 aux Iles) ainsi qu'1 aide-technicienne en Province Nord.

- 1 coordinatrice en Province des Iles Loyauté

- 1 coordinatrice en Province Sud

- Une équipe administrative composée de 2 personnes ( 1 Directeur et 1 secrétaire).

ARBOFRUITS est également l'un des acteurs du réseau de surveillance de la mouche des fruits et participe à la rédaction du Bulletin de Santé du Végétal (BSV) en collaboration avec le Groupement de Défense Sanitaire des Végétaux (GDSV) de la Chambre d'Agriculture (CANC).

L'association participe également au recueil de données statistiques, notamment pour mieux connaître son public d’arboriculteurs et ses productions.